Уважаемый Александр!
Думается, что Сталину Церковь после провала на Ближнем Востоке перестала быть интересной, и он просто не стал вмешиваться, когда в так называемую "Вторую волну" стали сажать и церковников.
Настоящие гонения начались при Хрущеве, когда были закрыты 99% оставшихся и открытых при немцах монастырей, и более 10 тысяч храмов по всему СССР. Никита считал, что среди прочего и этим он борется с пережитками культа личности Сталина.