Будут ходить со мной обе, но младшую смогу причастить, а старшую нет. И как мне объяснить старшей, которая будет во всём следовать младшей. Ей тоже захочется, как сестричке. Та получится отвергнута?

А что делать? Пока - так... А там, как Господь даст.
Важно - что вы все - в одном храме и вместе.
И дома - тоже по-православному...
А степень участия сестер - разная.

Но!
Вы и слов таких не говорите:отвергнута.
Говорите хорошо...
Придет время и Бог всё устроит...